安徽省各地市將此次“三線三邊”整治活動作為清理非法碼頭,整治岸線環境的契機,部分地市對航道環境、非法小碼頭、碼頭環境的整治工作推動較快。淮南、合肥、蚌埠、滁州、銅陵等市對非法小碼頭、碼頭環境的整治工作走在全省的前列。
合肥市結合對南淝河左、右岸堤防綜合治理工程的實施,合肥港南淝河港區上游部分碼頭被拆除,使得南淝河港區碼頭布局整體上的小、散、亂局面有所改觀;蚌埠市港航局結合防汛及港口岸線清理工作,對影響最嚴重、分布最集中的淮河岸邊懷遠馬城作業區和澮河岸邊固鎮城關作業區兩處的小碼頭進行了重點清理整頓;銅陵市港航管理局對港口碼頭作業區的環境整治檢查整改工作全面展開, 8月底前已安排整治資金2000萬元。目前,全省共拆除碼頭76座、關停25座,拆除關停碼頭泊位204個,拆除關停港口吞吐能力約2600萬噸,改造碼頭34座。