根據《廈門港總體規劃(修編)》，未來，廈門港全港規劃可形成碼頭岸線總長約94.3公里，規劃泊位379個，規劃可形成通過能力約5.8億噸/年(其中集裝箱通過能力2020萬標箱/年)。

海滄港區：以集裝箱干線運輸為主，兼顧石油化工和煤炭等散貨運輸，積極發展保稅港區和現代物流服務功能。

翔安港區：以承接東渡港區石材、散雜貨和內貿集裝箱運輸功能搬遷起步，逐步發展成為以集裝箱運輸為主，兼顧散雜貨運輸等功能。

招銀港區：以集裝箱、雜貨運輸和臨港工業發展為主，兼顧散糧、建材和客滾運輸。

后石港區：主要為后方臨港工業服務，以石油化工、LNG、煤炭等大宗液體散貨、干散貨運輸為主。

石碼港區：主要服務漳州龍海地方經濟，以雜貨和建材運輸為主。

古雷港區：主要服務大型臨港石化產業園，以石油化工運輸為主，兼顧散雜貨運輸，是以工業港為特色的大型深水港區。

云霄港區：服務周邊地區經濟和臨港工業開發，初步規劃以散貨和雜貨運輸為主，可承接廈門灣修造船等臨港工業功能。

東山港區：以服務臨港工業和地方經濟發展為主，城 、銅陵作業區發展散雜貨和對臺客滾運輸，冬古作業區以服務城市旅游為主，兼顧油品運輸。

詔安港區：服務臨港工業和地方經濟發展，以散雜貨運輸為主。

廈門港口管理局蔡良涯局長表示，下一步，廈門港將支持東山建設“國際旅游島”。同時，加快有關岸線、碼頭、建設的審批效率，優化審批程序，減少審批環節。

此外，廈門市財政還將加大對漳州市方面的傾斜和投入。從今年起近三年，每年投入1000萬元用于漳州市港區公共基礎項目建設。